独角兽高达搭载有高度机密的“NT-D系统”，字面意思为“新人类驱动系统”，其真实意义则为“新人类毁灭者系统”。一如其名，为了毁灭新人类而存在的系统。当头部的角状天线与精神感应框架连动，探测到NT的存在，系统就会启动，机体自动转入毁灭模式——将NT根绝。事实上，当该机的机师自身就是NT的时候，系统也会对机师自身强烈的脑波产生反应，因此在某种程度上达到任意发动NT-D的情况也是有可能的。

除了NT-D系统外，独角兽高达还搭载了当时最为先进的“意识自动匹配系统”。该系统实质上是新型精神感应操作系统，可以自动识别机师的感应波，并直接作用于机体的行动。当NT-D系统启动，机体进入毁灭模式时，该系统将机师的直接思考反映为行动意识，并传达到遍布全身的精神感应框架，使机师不需要进行任何实际操作，可以将思想直接传达给机体并立刻加以实施，如同活动自身的肢体一般，从而达以往的操作方式无论如何也无法匹及的迅速和便利。

然而，当20米级别的机动战士如普通人一样运动自如的场合，其高运动性带来的加速度会达到对机师肉体承受能力十分危险的级别。此外，考虑到使用精神感应所造成的精神负荷，系统的最高稼动时间约为5分钟。在一般情况下，机体只能在被施加限制的“独角兽模式”下经由手动进行普通的操作，而在“毁灭模式”启动时，机体的性能限制被解除，其性能的大幅提高能够达到在对手看来“有如瞬间移动”一样的可怕机动性能。另外，在系统启动时，驾驶舱内的线形座椅也会发生变化，驾驶面板和操纵杆会自动收起，座椅向后仰起，将机师固定在以脑波对机体进行控制的最适化姿态，并缓解高机动战斗时带来的震颤，同时，向机师体内注射名为“DDS”的抗G力药剂，提高体内血液循环的活性化，以抑制重力加速度所带来的代谢停滞。

作为NT毁灭兵器的杀手锏，NT-D系统最为可怕的性能在于夺取对方无线精神感应武器的控制权。借由机体搭载的全身精神感应骨架的增幅效果，NT-D系统散发出远强于对手的精神感应波，在扰乱对方精神感应控制的同时强制性的剥夺其系统对于远程浮游感应兵装的制御能力，再通过自身强大的精神感应加以俘获并使用。

另一方面，除该机机师外，该系统还能捕捉到敌方机师的感应波，根据其思维来预读将要发生的攻击。此外，在紧急事态发生，该机机师的思想来不及反应的情况下，该系统可以根据接收到敌性思维来直接接管机体控制并作出对应的处理。而在这种情况下，机师的杀意经由精神骨架增幅，往往使得自身沦为系统的一部分。