以MS-05B扎古Ⅰ（后期生产型）为基础，还诞生了番号为MS-05S的指挥官用型的扎古。S型主要是以机动性为中心对B型机进行改修所得到的机体，基本性能与B型机相差无几，主要配给了指挥官使用，头部的角状天线强化了机体的通信能力，也是区别于普通MS的显著标志。