U.C.0083年马哈拉加·坎恩逝世,其女儿哈曼·卡恩在夏亚的推荐下成为新的领导人。但哈曼一改父亲的作风,以力图重返地球圈为目的大力扩充军备,对付反对派。夏亚虽反对哈曼的作风,但在此时他已经没有能力挽回大局,以实现父亲伟大理想为目标的夏亚又再次失望,于是加入了反地球联邦武装组织——奥古。
U.C.0087年3月2日夏亚驾驶力克·迪亚斯在青色诺亚2的平民少年——卡缪·维丹的协助下夺取了泰坦斯秘密开发的高达Mk-II的2号机和3号机。
8月16日夏亚与布列格斯·弗拉准将一起出席由联邦政府召开的会议,翌日凌晨布列格斯·弗拉准将遭到泰坦斯暗杀,夏亚成为奥古最高领导人。同时,在地球降落作战行动中夏亚又遇到了昔日的宿敌阿姆罗,但这时他们却是一起反抗泰坦斯的同志而不是敌人。
10月12日阿克西斯回归地球圈,与交战中的希洛克舰队和阿伽玛战舰遭遇,并协助阿伽玛击退希洛克舰队。随后夏亚与布莱度等人登上阿克西斯旗舰格瓦丹号上进行交涉。当夏亚看到年幼的米涅瓦成为哈曼专政的傀儡时,平常十分冷静的夏亚也失去理智对哈曼大打出手。14日,交涉最终以破裂收场。随后在15日阿克西斯与泰坦斯联合,奥古的形势急转直下。同时泰坦斯在联邦议会中的势力日益增强。
11月16日夏亚公开了自己是吉翁·戴肯之子身份的秘密。
U.C.0088年2月22日奥古、泰坦斯和阿克西斯的部队展开舰队战,泰坦斯舰队遭受殖民地雷射炮攻击,最终以全灭收场。奥古与阿克西斯的部队伤亡惨重,夏亚驾驶百式与哈曼的卡碧尼交战,机体被重创大破,夏亚虽侥幸生还,但目睹自己亲手栽培并给予厚望的NT卡缪·维丹在战斗中精神失常,夏亚想起了拉拉的NT悲剧,他意识到要拯救人类、要实现全人类的革新只有把一切战争的祸端消除;而这个祸端就是地球联邦政府和那些久居地球的腐败分子;于是新的作战计划开始在赤色彗星的心中酝酿,他随后将自己隐藏了起来直至第二次新吉翁战争。