以大黑岛火山爆发为契机出现的新的哥斯拉，原本是拉哥斯岛的哥斯拉龙受氢弹爆炸的影响而变成的。以核物质为能源因而袭击了核潜艇与核电站。体内能进行核反应，并有归巢的本能。各方面能力均全面强于昭和时期的二代目与其他同世界观的怪兽。

《哥斯拉》中最后落入三原山火山口，《vs碧奥兰蒂》中因恐怖分子引爆三原山口而复活，后因体内被打入噬核细菌，最终在日本海停止活动。《vs王者基多拉》中因未来人改变历史而变为新三代目哥斯拉。

因未来人改变历史，由三代哥斯拉变为新三代哥斯拉。腰部有被称作“第二脑”的神经节，以杜鹃鸟借巢方式养育后代。各方面能力均远超原本的三代目，并且其能力在历年均会翻倍，样貌也有一点不同。处于红莲的熔融状态时，理论上能力与光线威力均会无上限暴增，射线是三代目射线能力的200倍，与王者基多拉同为“震撼宇宙的神魔之力”。在《哥斯拉vs太空哥斯拉》中，与可以承载无限宇宙能量、毁灭了多颗星球的太空哥斯拉进行战斗，逆向吸收其能量并将其击败。在《哥斯拉vs戴斯特洛伊亚》中因巴斯岛的天然铀喷出导致体内核反应失控，变为红色皮肤并冒着热气的姿态，此状态被称为“燃烧的哥斯拉”，又被粉丝们称为＂红莲哥斯拉＂，最终因核反应失控而死。小哥斯拉吸收了释放出来的能量，复活成长为新一代哥斯拉，并在同人转正的短片《哥斯拉vs盖刚》中大战盖刚雷克斯与其他普通盖刚。（注：这里有一个误区，片中出现的小哥斯拉常被认为与新三代目哥斯拉是父子关系，但其实他们并不是父子，而仅是同族。）

平成哥斯拉没有保留昭和电影中第二代哥斯拉的英雄性格，而是回到了最初哥斯拉的对抗性角色。《哥斯拉的归来》和《哥斯拉与生物兰特》强调，哥斯拉从核电站等原子能来源中获得营养，这使他对人类的攻击成为一种生物学上的当务之急，尽管他在这些电影期间和之后摧毁了意图不太明确的城市。在《哥斯拉大战机械哥斯拉II》中，哥斯拉开始转变为一个反英雄角色，收养了一个婴儿作为他的儿子。在平成系列的最后两部电影中，哥斯拉与纯粹邪恶的怪物太空哥斯拉和戴斯特洛伊亚作战，而人类通灵师三枝未希坚持认为哥斯拉实际上是一个具有人类情感的智慧生物。这在《哥斯拉与戴斯特洛伊亚》中有所体现，当戴斯特洛伊亚杀死他的儿子时，哥斯拉表现出明显的悲痛。

登场电影：《哥斯拉1984》（又称《哥斯拉 怪兽王复活》）、《哥斯拉vs碧奥兰蒂》、《哥斯拉vs王者基多拉》、《哥斯拉vs魔斯拉》、《哥斯拉vs机械哥斯拉》、《哥斯拉vs太空哥斯拉》、《哥斯拉vs戴斯特洛伊亚》