本機の運用システムの中核をなす機体であり、A、Bパーツの共通の制御ユニットとしても機能する。RX-78ガンダム用のコア・ファイターと区別するため「ネオ・コア・ファイター」とも呼ばれ、ゲームでは「コア・ファイター（ΖΖ）」と表記されることが多い。ドッキング時にはコクピットとなるキャノピー・ブロックを中心に、左右には熱核反応炉とスラスターを複合したユニットを配し、これに小面積のウィングを持たせることで小型戦闘機としての能力を持たせている。ドッキング時には主翼・垂直尾翼を収納、及びエンジン・ナセルを引き込み、機首を下面に180度回転することでコア・ブロックに変形する。

グリプス戦争期に採用された、リニアシートを用いた脱出ポッドは移動能力を持たないため、回収能力が当初の見積もりよりも低かったことから採用された。コクピット・ブロックは球形コクピットと同等の機能を有し、単体での生存性が十分に確保されている。サイコミュのメインプロセッサー、及び通常であれば頭部に搭載されるコ・プロセッサーもこのユニットに搭載されており、当時最高水準の演算能力を備えている。

機首及びエンジン・ブロック下部にランディング・ギアを有する。武装は2連装ミサイル・ランチャー2門と機銃（スペック表には記載されていないが、劇中で使用されている）。ΖΖガンダムを構成する3機のユニットにおいては最も小型であるが、第35話では機銃で推進器を狙撃することにより、重MSドライセンをベースジャバーから落としている。

なお、本機の後部にブースター・ユニットを装着した「コア・ブースターII」もデザインされたが、ラフデザインの段階で没になっている。