MSJ-06Ⅱ-C/BT 铁人式·高机动B指挥官型是MSJ-06Ⅱ-C／B铁人式·高机动B型的指挥官专用机，与普通的高机动B型的区别主要在上半身，指挥官专用型增加了强化通讯的天线，并且将肩部的盾牌大型化，而腿部的悬浮推进器的能力也得到了增强，令该型机在地上的移动速度仅次于MSJ-06Ⅱ-SP铁人式·桃子。

人革联每一种不同适用环境的铁人式都存在指挥官专用型，铁人式·高机动B指挥官型整体与铁人式·高机动B型并无差异，但针对通讯和资讯收集能力进行强化。外观上肩部和头部造型与一般型不同，头部比起通常型来说更为方正，并在中央追加了感测器以强化资讯收集能力。肩部由通常型的盾牌装甲变更为可动式装甲，在装甲上还追加了感测器和通讯用的天线，增强了作为指挥官用机的性能。人革联的MS部队通常由10机组成，1架指挥官型，其余的标准型以3机为一组分为3组行动。在沙漠中部署的单位为了对应在沙漠中行动，同样在脚部和上半身关节部位进行了包含密封处理在内的许多对策措施。

主要武装200mm×25口径滑膛炮，安装在前臂，可以使用各种类型的弹药来对应多种战况。与普通的MSJ-06Ⅱ-A铁人式·陆战型不同的是，该型机的滑膛炮沿着炮管装备着一面由超硬碳材料制成碳钢刀片，为方便架在左腿部的E碳盾牌因此只装备一面碳钢刀片。