AEU-09T AEU制定式指挥官型是专门配备给指挥官用的AEU-09AEU制定式，头部的设计与标准型有所不同。帕特里克·克拉萨瓦中尉在撒哈拉沙漠捕捉天人的高达型MS时驾驶的便是该机。