MSN-01 塞可缪运用试验用扎古是在MS-06Z塞可缪搭载实验型扎古的基础上改修而来的，同样采用了扎古为母体，推进器的加速性能无法满足机体在高速机动战时的需要。

U.C.0079年11月8日，塞可缪搭载实验型扎古在暗礁宙域实验时遭遇地球联邦军的哨戒部队，在全歼联邦军哨戒部队的同时二号机也被大破，送回改修时设计人员干脆废除了机体的脚部，而代之以大推力的火箭式推进器，使机体的加速性能得到飞跃的提高。机体加速性的问题虽然解决了，新的问题又出来了：燃料的消耗速度加快了，但搭载量并没有随之提高，这样机体的行动时间不得不大幅度缩减。

U.C.0079年11月26日，吉翁公国军将NT用MS的番号统一归类为MSN。自此，塞可缪搭载实验型扎古二号机正式改称为MSN-01 塞可缪运用试验用扎古（High Mobility Psycommu System Zaku）。而在地球联邦军攻陷所罗门要赛后，联邦军捕获了一台紫色涂装的该型机。

《机动战士高达：雷霆宙域战线》中，阿·巴瓦·库战役时吉翁军也投入了一台该型机，由NT机师比利·希卡姆少尉驾驶。