F90高达水中型是高达F90的特殊装备机之一、通称为“Marine”型的水中型MS。

自RAG-79-G1水中型高达以来，地球联邦军还没有一款真正意义上的水陆两用MS。RAG-79水中型吉姆更是自U.C.0079年问世以来一直用到了U.C.0090年代，当然一方面也是因为自从一年战争以后地球本土受到的威胁有限，所以也不需要再水中花太多的精力造新型MS。

而这次，海军战略研究所的技术人员以F90高达为母体设计出了这一款机体，该机在背部装设了水中用引擎，减轻了能量的负担。如此改装后的F90M在水中的速度可以达到90节，最大下潜深度为400米。武装方面，有两门头部60mm火神炮、一柄格斗小刀、两枚腕部水中火箭发射器、两枚脚部2连装自动引导式鱼雷、一枚6连装弩式发射器。